Le sergent Keroro est le capitaine de l'équipe d'invasion spatiale spéciale de la 58ème planète du système de nuages de tempêtes Gamma, envoyé sur la planète Pokopen (ou Terre) pour collecter des informations pour la force d'invasion de son planète. Il est également un crapaud. Après que son vaisseau s'est écrasé sur la planète Terre, il prend refuge dans la maison Hinata, mais les deux enfants, Fuyuki et Natsume, le découvrent et lui prennent la chance d'invader la planète.