La historia continúa donde la primera temporada dejó sólo unos meses en el futuro. Yuokai Gakuen ha sido reparado y el nuevo semestre está en marcha. Tsukune y su pandilla están de vuelta, y son más poderosos que nunca. La verdadera identidad de Anti-Tesis es relevada. Con nuevos adversarios que se avecinan en el horizonte, y algo mucho más siniestro de lo que la pandilla ha enfrentado antes.
Tsukune está luchando con el monstruo que lleva dentro. Con la ayuda de Moka, Mizore, Kurumu, Ruby y Yukari. Tsukune se entrena para tener su sangre de vampiro bajo control y la fuerza para proteger lo que más quiere.
La nueva temporada se centra más en las chicas, su pasado y sus familias. Nuevos enfrentamientos les esperan. Nuevos amigos y aliados se les unirán a su lado. Juntos descubrirán los secretos del rosario de Moka, y su linaje…
