A mediados del periodo Heian, la pequeña isla de Onishima está aislada de la civilización.
De niña, Torago estaba jugando junto al mar con su hermana, Tana, cuando esta desapareció por causas ajenas a su voluntad.
Sin embargo, no fue culpa de Torago, sino de otro niño que jugaba con ellas.
Torago y el chico crecen juntos, ambos llenos de culpa, y más tarde terminan juntos, pero un día una mujer que se parece a «Tana» aparece en Onishima...
