يحكي Eden الماضي قصة شباب في اليابان بعد الكارثة. بينما يتم تناول "الدواء" الذي يقدمه الحكومة لهم لخفض الخوف، يُسلّط على طلبة المدرسة المتوسطة السلاح لقتال "العدو" الذي يهاجمهم. بينهم فتاة تدعى Chikori، فتاة عادية تود أن تقع في الحب. ومع ذلك، مع العالم كما هو، فإن العادي صعب…
